制药工程学院成立于2014年，致力于医药和健康高技能人才培养，现有药品生产技术（药品生产技术、生物制药技术、中药材生产与加工等专业组成）和智慧健康（药品经营与管理、健康管理、康复治疗技术等专业组成）两大专业群；其中药品生产技术专业群于2025年1月以“优”等级通过重庆市首期双高建设验收。

学院现有专业教师86人，其中“双师型”教师占83.7%，师资队伍数量充足、德技双馨、结构合理，获得国务院政府特殊津贴、全国劳模等称号4人次，市级产业技术带头人、教书育人楷模等称号8人次；建有教育部双师型教师培训基地等3个国家级平台，教师企业实践流动站等3个市级平台，黄大年式等市级教师团队2个。