制药工程学院成立于2014年，致力于医药和健康高技能人才培养，现有药品生产技术（药品生产技术、生物制药技术、中药材生产与加工等专业组成）和智慧健康（药品经营与管理、健康管理、康复治疗技术等专业组成）两大专业群；其中药品生产技术专业群于2025年1月以“优”等级通过重庆市首期双高建设验收。

学院实训条件优越。实训面积达10000m2，仪器设备总值2300万元，拥有国家级协同创新中心1个、国家级高技能人才培养基地1个、国家级双师型教师培养培训基地1个、市级应用技术推广中心1个、市级技能大师工作室1个、市级黄大年式教师团队1个、市级教师教学创新团队1个、市级现代学徒制试点班1个、市级产业学院1个、市级教师企业实践流动站1个。

学院师资力量雄厚。现有专业教师86人，其中“双师型”教师占83.7%，师资队伍数量充足、德技双馨、结构合理，获得国务院政府特殊津贴、全国劳模等称号4人次，市级产业技术带头人、教书育人楷模等称号8人次；建有教育部双师型教师培训基地等3个国家级平台，教师企业实践流动站等3个市级平台，黄大年式等市级教师团队2个。

学院以高质量培养和高质量就业为导向，专升本考试通过率、学生综合素质测评第三方评价居学院前列，教师编写教材20多本，其中入选首批“十四五”职业教育国家规划教材1部。教师指导学生近两年获市级以上竞赛奖50余项，其中2024年世界职业院校技能大赛药品生产赛项争夺赛获金奖，2025年世界职业院校技能大赛医药生产与经营赛项争夺赛获金奖并进入排位赛。学院与药友制药、科瑞制药、博腾制药、万和药房、丽兹卡尔医院等70余家医药头部企业深度合作近10年，与长寿经开区和全国医药行业建立了生物医药联合体3个，共同体7个，建立了园政行企校五方为主体的多元育人体系，创新“三位一体、三段递进、三个融合”的人才培养模式，开办“博腾”“药友”“万和”等学徒制班，为区域生物医药产业培养高技能人才，用人企业满意度第三方评价达96%以上。